За более чем 60-летнюю историю, кафедра экономики инноваций (ранее кафедра экономики и планирования промышленности (1955-1992) и экономики предприятия и основ предпринимательства (1992-2007)) построила систему, охватывающую все звенья научно-образовательного процесса. Она прошла значительный путь развития и трансформаций при исследовании самых актуальных проблем промышленности, становления фирм и основ предпринимательства. Сейчас все эти направления в деятельности кафедры интегрированы, ведь развитие всех этих направлений в стране возможно только на новой научно-технологической основе и при условии развития инноваций во всех сферах российской экономики.

Межфакультетское взаимодействие ведётся на уровне научных междисциплинарных исследований, где наш факультет выполняет функции постановщика задач, а затем координатора и интегратора совместной работы. Кафедра также проводит научные исследования по инновационной тематике по заказу крупных компаний, таких как РЖД, Росатом, McKinsey, Роснефть и других.
Кафедра создала и продолжает развивать на экономическом факультете инновационную инфраструктуру, формируя партнёрские отношения с родственными структурами как внутри университета, так и за его пределами. Созданные кафедрой центры – это и Бизнес-клуб МГУ, и Бизнес-инкубатор МГУ, и Аналитический консалтинговый центр, и Российское представительство Международной ассоциации «Тройной спирали», и вышедшая из недр кафедры лаборатория инновационного бизнеса и предпринимательства – InnovationStudiо. Деятельность этих инновационных структур осуществляется в тесном взаимодействии с надёжными партнёрами – «Иннопрактикой» и Научным парком МГУ.